CUT&Tag是蛋白質(zhì)-DNA互作關(guān)系研究的新方法，2019年弗雷德哈欽森癌癥研究中心的Henikoff博士在Nature Communication公開了該技術(shù)的詳細結(jié)果與實驗方案。與以往的ChIP-Seq、pA-MNase等方法相比，這種技術(shù)方法簡便易行，信噪比高，重復(fù)性好，需要的細胞數(shù)量少至60個細胞，且有望將ChIP-Seq做到單細胞水平。
開發(fā)的技術(shù)，使用核酸酶在靶標下切割和釋放(CUT&RUN-sequencing)以及在靶標下切割和標記（CUT&Tag-sequencing），用于從低輸入材料來繪制蛋白質(zhì)-DNA相互作用，并顯著提高了映射分辨率。然而，這兩種技術(shù)的成本都較高。CUT&RUN-sequencing使用昂貴的 pA/MNase融合蛋白，該蛋白具有顯著的A/T序列偏差，導(dǎo)致目標蛋白結(jié)合的DNA 區(qū)域譜受到MNase消化水平的嚴重影響。CUT&Tag-sequencing顯示出相同的消化偏差，并且由于Tn5轉(zhuǎn)座酶導(dǎo)致染色質(zhì)的脫靶可及性，因此特異性較低。
為解決這些問題，EpiGentek開發(fā)了兩種新技術(shù)—CUT&RUN Fast和CUT&Tag In-Place-Sequencing，用于快速富集與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA，并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用圖。新技術(shù)具有“兩高一低”的優(yōu)勢：高分辨、高時效以及低輸入。
艾美捷 EpiGente CUT&RUN和CUT&Tag技術(shù)來了。特別是 EpiQuik CUT&RUN M6A RNA富集試劑盒（P-9018）和EpiNext CUT&RUN M6A RNA-Seq試劑盒(P-9016)，可以在zui小的非特異性背景水平上，從低輸入RNA樣本中特異性捕獲和富集含有m6A修飾的RNA片段。富集的 RNA 特別適用于快速構(gòu)建非條形碼（單重）和條形碼（多重）文庫，允許以更小的偏差和高分辨率繪制 m6A 區(qū)域。
結(jié)果展示：
艾美捷 CUT&Tag技術(shù) 相關(guān)研究工具：
cat# 名稱 時長
P-2028 EpiNext CUT&RUN Fast Kit <3小時
P-9018 EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit <3小時
