根據(jù)細胞凋亡檢測固有的形態(tài)特征，人們已經(jīng)設(shè)計了許多不同的細胞凋亡形態(tài)學檢測方法。
1 光學顯微鏡和倒置顯微鏡
（1） 未染色細胞：凋亡細胞的體積變小、變形，細胞膜完整但出現(xiàn)發(fā)泡現(xiàn)象，細胞凋亡晚期可見凋亡小體。
貼壁細胞出現(xiàn)皺縮、變圓、脫落。
（2） 染色細胞：常用姬姆薩染色、瑞氏染色等。凋亡細胞的染色質(zhì)濃縮、邊緣化，核膜裂解、染色質(zhì)分割
成塊狀和凋亡小體等典型的凋亡形態(tài)。
2 熒光顯微鏡和共聚焦激光掃描顯微鏡
一般以細胞核染色質(zhì)的形態(tài)學改變?yōu)橹笜藖碓u判細胞凋亡的進展情況。
常用的DNA特異性染料有：HO 33342 （Hoechst 33342），HO 33258 （Hoechst 33258）, DAPI。三種染料與DNA的結(jié)合是非嵌入式的，主要結(jié)合在DNA的A-T堿基區(qū)。紫外光激發(fā)時發(fā)射明亮的藍色熒光。
Hoechst是與DNA特異結(jié)合的活性染料，儲存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度，使用時用PBS稀釋成終濃度為2~5mg/ml。
DAPI為半通透性，用于常規(guī)固定細胞的染色。儲存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度，使用終濃度一般為0.5 ~1mg/ml。
結(jié)果評判：細胞凋亡檢測過程中細胞核染色質(zhì)的形態(tài)學改變分為三期：Ⅰ期的細胞核呈波紋狀（rippled）或呈折縫樣（creased），部分染色質(zhì)出現(xiàn)濃縮狀態(tài)；Ⅱa期細胞核的染色質(zhì)高度凝聚、邊緣化；Ⅱb期的細胞核裂解為碎塊，產(chǎn)生凋亡。
大鼠嗜堿性粒細胞性白血病細胞；RBL-2H3
大鼠腎上腺嗜鉻細胞瘤細胞(低分化)；PC-12(低分化)
大鼠腎上腺嗜鉻細胞瘤細胞(高分化)；PC-12(高分化)
大鼠骨髓瘤細胞；Y3-Ag 1.2.3
大鼠骨肉瘤細胞；UMR-106
大鼠骨髓瘤細胞；Y3-Ag 1.2.3
大鼠骨肉瘤細胞；UMR-106
大鼠腎上腺嗜鉻細胞瘤細胞；PC-12 [PC12]
正常大鼠腎細胞；NRK
大鼠肝細胞瘤；H-4-II-E
大鼠腎小球系膜細胞；HBZY-1
細胞凋亡檢測