如果有氣泡不斷從流路進入泵，則檢測池中非常容易出氣泡(但并不一定)。在實際中如果使用二路以上的流動相，即使流路沒有氣泡進入，也不見得檢測池不會產生氣泡。

簡單判斷檢測池有無氣泡存在非常容易，用手指或其他東西按住排液管的出口，如果基線有明顯的變動、變穩，原來出現無規則的峰不見了，則池內有氣泡存在。氣泡峰的產生一般是沒有規律的，如果從檢測器的圖譜看，直上、直下成直角的峰大多是氣泡峰;緩慢上去，突然直角下來的峰在絕大多數情況下也是氣泡產生的;如果基線一直向上漂，按住排液口后，基線突然下來就是存在氣泡的緣故。氣泡在檢測器產生的信號有時不一定很大，有些氣泡產生的小峰看上去很對稱，比較難判斷。在實際操作中，可通過重復進樣，從峰的寬度和出峰時間來綜合判斷，無規則出現的峰(鬼峰)多為氣泡峰。

要不讓氣泡的產生，首先要對各路流動相進行脫氣，定期檢査吸濾頭是否有阻塞現象;或者采用單路流動相(先將各路流動相混再脫氣);采用在線脫氣器;在檢測器的排液管后再加一段不銹鋼管或很短的柱子(如不用的保護柱)，増加反壓，壓力不能太高。如果是示差折光檢測器，要格外小心，因為示差折光檢測器檢測池的耐壓能力比紫外檢測器的小。

   對于檢測池中的氣泡，有一個簡便有效的方法：先用手指或其他東西按住排液管的出口，再松開，重復操作幾次，基本上都能排除氣泡。