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　　近些年來，由于抗菌藥物的廣泛使用，細菌耐藥性不斷加強，而且很多細菌已由單藥耐藥發展到多重耐藥。飼料中添加抗菌藥物，實際上等于持續低劑量用藥。動物機體長期與藥物接觸，造成耐藥菌不斷增多，耐藥性也不斷增強。

　　現在人們很關注的一個問題是動物病原菌的耐藥基因是否會傳遞給人類病原菌。因為已經證實，人與人之間、動物與動物之間均存在耐藥基因的傳遞問題。如那些本身與抗生素沒有直接接觸，但卻與正在或曾與抗生素接觸的人是近鄰的人，均發現攜帶有大量耐藥質粒。而住在世界上從未使用過抗生素地區的人群體內，也發現了這些質粒。動物的情況也與人相似。而關于人和動物之間耐藥質粒的傳遞問題，一直存在著爭論。但有一些實驗已經證實了耐藥基因是可以在人和動物之間相互傳遞的。

　　長期接觸某種抗生素，可使機體體液免疫和細胞免疫功能下降，以致引發各種病變，引起疑難病癥，或用藥時產生不明原因的毒副作用，給臨床診治帶來困難。臨床上使用芐丙酮豆素時，常可能導致出血。婦女常出現月經過多、經期紊亂、性功能紊亂等癥，且久治不愈。引起這些病癥的一個重要原因是肉食品中維生素E的殘留，為維生素E可對維生素K產生拮抗作用所致。臨床醫生一般難以考慮到這一點。維生素E在畜牧生產中稱為萬能維生素，對于畜禽的生長、保育均有很重要的作用，投放量大，引起的殘留量也大。