電磁流量計穩定性比較高，一般很少發生故障，但由于環境條件的變化或安裝工況條件所限，也可能發生一些問題或故障，應該加以解決或避免，大致主要表現為以下幾種情況：
 1、被測水的流速過低，由此影響測量的精度。特別是在一些區域邊界安裝的電磁流量計，由于處于區域公司管網末梢，壓差小而造成流速過低。其解決辦法是盡量開啟邊界兩邊閥門。
2、沒有滿足流量計的安裝條件，電磁流量計對管道的直管段要求較高，在新建水廠設計時可以盡量滿足，而對老水廠改造或加裝來說，以上條件就變得幾乎苛刻。由此影響了測量穩定性。其解決方法為加裝整流管以改善流動特性。
3、安裝在原水管道中電磁流量計的傳感器電極表面被淤泥沉積污染，影響測量。其解決方法為選用自動清理式電極，并定期進行維護清洗。
4、管道水中有氣，造成電磁流量計測量波動大影響穩定性。其解決辦法要設法找到氣的來源并加以解決，必要時在管道中加裝排氣閥。
5、電磁流量計入口管道中異物堆積，造成被測水體流動特性突變由此影響測量精度造成較大的誤差。其解決方法為及時清除管道中堆積的異物。
6、雷擊造成電磁流量計的轉換器損壞，以致無法測量。其解決辦法為在轉換器信號輸人端、勵磁電流輸人端和工作電源端分別加裝相應的避雷器。