毛細管色譜柱規格的選擇：

長度：

5-12m短柱：分離少于10個組分（不包含難分離物質）的簡單樣品。

25-30m中長柱：分離10-50個組分的樣品。

50m長柱：分離大于50個組份或包含有難分離物質的復雜樣品。

內徑：

0.53mm具有近似填充柱的負荷量，總柱效則遠遠超過填充柱。達到同樣的分離度時，0.53mm大口徑柱的分析時間顯著快于填充柱。可方便的采用柱上進樣或直接進樣技術，適合于分析不太復雜的樣品，是填充柱理想的替代柱。

0.32mm柱效稍低于0.25mm常規柱，負荷量大于常規柱的60%，用特制注射針可做柱上進樣。

0.25mmzui常用的內徑規格。有較高的柱效，負荷量較低，必須分流進樣或無分流進樣。用于復雜多組分樣品分析。

0.2mm柱效高，負荷量低，流失較小，適合與質譜等靈敏檢測器聯用。

膜厚：

0.1-0.2um薄液膜：低負荷量，高溫下流失較小，適合于高沸點化合物的分析，適于配高靈敏檢測器。

0.25-0.33um:標準液厚

0.5-5.0um厚液膜：較高的樣品負荷量，在高溫下流失較大，適于分析低沸點樣品。