1、色譜柱的柱效和保護柱

       拿到一根新柱時，一定要先看其使用說明，然后測柱效，定期檢測柱效，保留在新色譜柱上得到的色譜圖，并記錄條件，定期檢測儀器的譜帶展寬，若應用于在線監測，應對色譜柱提供在線的物理保護和化學保護，例如采取安裝在線過濾器，自裝填料保護柱和預裝保護柱等。在線過濾器的作用是防止顆粒在柱頭累計，優點是基本不影響柱效，在需要高柱效的時候常用，常更換的消耗品是濾芯和墊圈。

       保護柱的作用是防止柱子被化學污染，缺點是多數保護柱影響色譜柱的柱效，特別是在用微柱時，常用的是普通自裝填料的保護柱。zui近新出的一些保護柱例如Sentry-guard保護柱,它的特點是高質量、填料、增加分析柱效、對臟樣品載荷能力大，能延長保護柱的壽命，手可擰緊接頭，安裝時不需要工具，省時省，可換芯式設計，能采用各種不同的填料，主要適用于非常臟非常復雜的樣品本底，例如，生化樣品，環境樣品和食品等，或者不想做太多的固相萃取，不想降低柱效果等情況。

2、色譜柱的清洗

       對所做的樣品要有充分的了解，用對該樣品洗脫能力zui強的流動相清洗，對于硅膠柱，先用甲醇洗去極性雜質，然后用干燥的二氯甲烷和正庚烷100-200mL 依次活化，對于鍵和相柱，一般用甲醇-氯方-甲醇-水依次沖洗， 每種色譜柱有特定的清洗方法， 一定要看其使用說明。

3、色譜柱的存放

      存放前除去雜質和鹽，采用合適的存放溶劑，避免色譜柱床的干枯，避免機械振動，防止細菌生長，注意存放的溫度。