1、應放在干燥的房間內，使用時放置在堅固平穩的工作臺上，室內照明不宜太強。熱天時不能用電扇直接向儀器吹風，防止燈泡燈絲發亮不穩定。
2、為了防止光電管疲勞，不測定時必須將試樣室蓋打開，使光路切斷，以延長光電管的使用壽命。
3、取拿比色皿時，手指只能捏住比色皿的毛玻璃面，而不能碰比色皿的光學表面。
4、比色皿不能用堿溶液或氧化性強的洗滌液洗滌，也不能用毛刷清洗。比色皿外壁附著的水或溶液應用擦鏡紙或細而軟的吸水紙吸干，不要擦拭，以免損傷它的光學表面。
5、使用前，使用者應該先了解本儀器的結構和工作原理，以及各個操縱旋鈕之功能。在未按通電源之前，應該對安全性能進行檢查，電源接線應牢固，通電也要良好，各個調節旋鈕的起始位置應該正確，然后再按通電源開關。
6、長期不用時，需用將儀器使用防護罩罩住。
火焰原子吸收分光光度計的清潔方法：
1、比如測定溶液是酸，如果不干凈，就用弱堿溶液洗，要是測定溶液是堿，如果不干凈，就用弱酸溶液洗，要是測定溶液是有機物質，如果不干凈，就用有機溶劑，比如酒精等溶液洗。
2、選擇比色皿洗滌液的原則是去污效果好，不損壞比色皿，同時又不影響測定。
3、火焰原子吸收分光光度計分析常用的鉻酸洗液不宜用于洗滌比色皿，這是因為帶水的比色皿在該洗液中有時會局部發熱，致使比色皿膠接面裂開而損壞。同時經洗液洗滌后的比色皿還很可能殘存微量鉻，其在紫外區有吸收，因此會影響鉻及其他有關元素的測定。一般主張使用過氧化氫和硝酸（5：1）的混合溶液洗，然后用水沖洗干凈。
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