一個典型的癌細胞，其整個基因組中散布著成千上萬的突變，攜帶著成百上千的突變基因。然而，卻只有極少的驅動基因會導致諸如失控性生長等癌變性狀。研究人員提出了“司機突變-乘客突變"學說。他將癌變的細胞比作高速公路上飛馳的汽車。能夠直接導致癌變的體細胞突變稱之為“司機突變"（Driver Mutation）；而與癌癥發生相關，但不是起主導作用的突變，則被稱為“乘客突變"（Passenger Mutation）。

    乘客突變（Passenger mutations）——伴隨著有意的遺傳修飾而出現的不必要改變，可能會扭曲利用某些類型轉基因小鼠的實驗結果。

    乘客突變會對使用轉基因動物模型（稱為同類系小鼠）的實驗產生影響。基因敲除和其他轉基因小鼠傳統上是通過對培養皿中生長的胚胎干細胞（ESC）進行基因修飾，然后將它們插入到受體小鼠胚胎中。直到zui近，這些細胞幾乎總是來自129品系小鼠，這種小鼠可產生非常強大和易于操作的胚胎干細胞。

    由于129品系小鼠很難繁殖，研究人員通常將它們的ESCs移植到Black 6小鼠的胚胎中，然后讓動物與Black 6配偶反復回交，同時選擇129品系小鼠衍生的轉基因，通過重組慢慢消除轉基因周圍的129品系小鼠DNA。理想的結果是，一個幾乎*具有129品系小鼠轉基因的Black 6小鼠。但是，轉基因周圍的129品系小鼠DNA*段，可能會逗留在附近。

    當研究人員將他們的基因修飾小鼠與Black 6小鼠比較時，他們觀察到，在129品系小鼠DNA中，有乘客突變引起的表型差異。例如，人們認為，Casp1基因是觸發炎癥反應和細胞死亡途徑響應外來生物的主要參與因子，與致命休克有關的一個步驟。這是因為，根據1995年的一項研究和以后的研究表明，當面臨分子信號外來入侵者時，Casp1基因敲除小鼠沒有發展成成膿毒性休克。然而，在2011年，Genentech的研究人員發現，許多Casp1基因敲除小鼠，也含有來自129小鼠的突變Casp11基因。研究人員發現，Casp11的乘客突變，部分地引起了動物對休克的抵抗。